Сохранение (экспорт) личного сертификата в формате .CER
Экспортировать сертификат открытого ключа можно одним из способов:
1) Через "Панель управления Рутокен"
"Панель управления Рутокен" - вкладка "Сертификаты" - выделяем сертификат, открытый ключ которого нужно выгрузить - кнопка "Экспортировать"
В окне экспорта личного сертификата оставляем пункт "DER-кодированный файл x509 (.CER)"
Нажимаем кнопку "Обзор" и выбираем путь куда будет сохранен экспортированный файл сертификата, после чего нажимаем кнопку "Экспортировать".
После получения сообщения об успешном выполнении экспорта, вы можете найти на компьютере экспортированный файл сертификата открытого ключа с расширением файла .CER 
2) Через "КриптоПРО CSP"
"КриптоПРО CSP" - вкладка "Сервис" - "Просмотреть сертификаты в контейнере" - "Обзор" - выбираем нужный контейнер с сертификатом - "ОК" - "Далее" - кнопка "Свойства" - вкладка "Состав" - кнопка "Копировать в файл..." - "Далее" - "Далее" - "Обзор..." - выбираем место для временного хранилища, например, "Рабочий стол" - в поле "Имя файла" вводим произвольное имя файла - "Открыть" - "Далее" - "Готово" - "ОК"